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Hecho en Colombia
Karen Lisbet Palacio Rodriguez
Grupo Tandem en Nano-bio-física
Universidad de Antioquia
Instituto Max Planck de Biofísica
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Exponential consensus ranking improves the outcome in docking and receptor ensemble docking
Acceso Abierto
ART-ART_A1
ID Minciencias: ART-0000387720-41
Fuente: Scientific Reports
Karen Lisbet Palacio Rodriguez
Isaias Lans Vargas
Claudio N Cavasotto
Pilar Cossio Tejada
Temas:
Virtual screening
Docking (animal)
Computer science
Decoy
Machine learning
Macromolecular docking
Artificial intelligence
Data mining
Computational biology
Pharmacophore
Bioinformatics
Protein structure
Biology
Medicine
Biochemistry
Receptor
Nursing
Publicado: 2019
Citaciones:
156
Altmétricas:
0
Artículo de revista
A Bayesian approach to extracting free-energy profiles from cryo-electron microscopy experiments
Acceso Abierto
Fuente: Scientific Reports
Julian David Giraldo Barreto
Jhoan Sebastian Ortiz Giron
Erik Thiede
Karen Lisbet Palacio Rodriguez
Bob Carpenter
Alex H Barnett
Pilar Cossio Tejada
Temas:
Cryo-electron microscopy
Biomolecule
Energy landscape
Biological system
Energy (signal processing)
Metastability
Computer science
Physics
Statistical physics
Materials science
Nanotechnology
Nuclear magnetic resonance
Biology
Thermodynamics
Quantum mechanics
Publicado: 2021
Citaciones:
42
Altmétricas:
0
Artículo de revista
Effect of calcium on gasification of carbonaceous materials with CO2: A DFT study
Acceso Cerrado
ART-ART_A1
ID Minciencias: ART-0000140848-3
Fuente: Fuel
Juan David González Ruiz
Fanor Mondragon Perez
Juan Fernando Espinal Lopez
Karen Lisbet Palacio Rodriguez
Temas:
Carbon monoxide
Catalysis
Chemistry
Desorption
Density functional theory
Chemisorption
Carbon fibers
Reaction rate constant
Activation energy
Reaction rate
Thermal desorption spectroscopy
Physical chemistry
Computational chemistry
Materials science
Adsorption
Kinetics
Organic chemistry
Physics
Quantum mechanics
Composite number
Composite material
Publicado: 2012
Citaciones:
39
Altmétricas:
0
Artículo de revista
Transition Rates and Efficiency of Collective Variables from Time-Dependent Biased Simulations
Acceso Cerrado
Fuente: The Journal of Physical Chemistry Letters
Karen Lisbet Palacio Rodriguez
Hadrien Vroylandt
Lukas S Stelzl
Fabio Pietrucci
Gerhard Hummer
Pilar Cossio Tejada
Temas:
Statistical physics
Transition rate matrix
Metadynamics
Transition (genetics)
Rate of convergence
Transition state theory
Convergence (economics)
Computer science
Mathematics
Physics
Statistics
Chemistry
Molecular dynamics
Quantum mechanics
Reaction rate constant
Telecommunications
Biochemistry
Economics
Gene
Channel (broadcasting)
Economic growth
Kinetics
Publicado: 2022
Citaciones:
21
Altmétricas:
0
Artículo de revista
dockECR: Open consensus docking and ranking protocol for virtual screening of small molecules
Acceso Abierto
Fuente: Journal of Molecular Graphics and Modelling
Rodrigo Alonso Ochoa Deossa
Karen Lisbet Palacio Rodriguez
Camila Mara Clemente
Natalia S Adler
Temas:
DOCK
Virtual screening
Computer science
Docking (animal)
Ranking (information retrieval)
Computational biology
Protocol (science)
AutoDock
Open source
Source code
Data mining
Machine learning
Chemistry
Bioinformatics
Drug discovery
Biology
Software
In silico
Programming language
Gene
Medicine
Biochemistry
Alternative medicine
Nursing
Pathology
Publicado: 2021
Citaciones:
20
Altmétricas:
0
Artículo de revista
E5M7+ (E=C–Pb, M=Li–Cs): A Source of Viable Star‐Shaped Clusters
Acceso Cerrado
ART-ART_A1
ID Minciencias: ART-0001603764-2
Fuente: Chemistry - An Asian Journal
Alejandro Vasquez Espinal
Karen Lisbet Palacio Rodriguez
Estefanía Ravell
Mesías Orozco Ic
jorge barroso
sudip pan
William Tiznado
Gabriel Merino
Temas:
Star (game theory)
Singlet state
Ring (chemistry)
Physics
State (computer science)
Atomic physics
Series (stratigraphy)
Field (mathematics)
Crystallography
Chemistry
Mathematics
Astrophysics
Pure mathematics
Algorithm
Organic chemistry
Excited state
Paleontology
Biology
Publicado: 2018
Citaciones:
15
Altmétricas:
0
Artículo de revista
In silico discovery and biological validation of ligands of FAD synthase, a promising new antimicrobial target
Acceso Abierto
ART-ART_A1
ID Minciencias: ART-0000387720-46
Fuente: PLoS Computational Biology
Isaias Lans Vargas
Ernesto Anoz Carbonell
Karen Lisbet Palacio Rodriguez
José Antonio Aínsa Claver
María Milagros Medina Trullenque
Pilar Cossio Tejada
Temas:
Virtual screening
In silico
Pharmacophore
Computational biology
Drug discovery
Docking (animal)
Small molecule
chEMBL
Combinatorial chemistry
Chemistry
Biology
Bioinformatics
Stereochemistry
Biochemistry
Medicine
Nursing
Gene
Publicado: 2020
Citaciones:
15
Altmétricas:
0
Artículo de revista
Flexi-pharma: a molecule-ranking strategy for virtual screening using pharmacophores from ligand-free conformational ensembles
Acceso Abierto
ART-ART_A2
ID Minciencias: ART-0000387720-47
Fuente: Journal of Computer-Aided Molecular Design
Isaias Lans Vargas
Karen Lisbet Palacio Rodriguez
Claudio N Cavasotto
Pilar Cossio Tejada
Temas:
Pharmacophore
Virtual screening
Flexibility (engineering)
Ranking (information retrieval)
Computer science
Ligand (biochemistry)
Chemistry
Advice (programming)
Molecular dynamics
Conformational isomerism
Steric effects
Computational biology
Combinatorial chemistry
Stereochemistry
Molecule
Artificial intelligence
Computational chemistry
Receptor
Mathematics
Biology
Biochemistry
Statistics
Programming language
Organic chemistry
Publicado: 2020
Citaciones:
10
Altmétricas:
0
Artículo de revista
Free Energy Landscapes, Diffusion Coefficients, and Kinetic Rates from Transition Paths
Acceso Abierto
Fuente: Journal of Chemical Theory and Computation
Karen Lisbet Palacio Rodriguez
Fabio Pietrucci
Temas:
Statistical physics
Propagator
Robustness (evolution)
Langevin dynamics
Computer science
Relaxation (psychology)
Kinetic energy
Mathematical optimization
Applied mathematics
Physics
Mathematics
Chemistry
Classical mechanics
Psychology
Social psychology
Biochemistry
Quantum mechanics
Gene
Publicado: 2022
Citaciones:
10
Altmétricas:
0
Artículo de revista
Optimal Reaction Coordinates and Kinetic Rates from the Projected Dynamics of Transition Paths
Acceso Abierto
Fuente: Journal of Chemical Theory and Computation
Line Mouaffac
Karen Lisbet Palacio Rodriguez
Fabio Pietrucci
Temas:
Reaction coordinate
Molecular dynamics
Kinetic energy
Kinetic Monte Carlo
Statistical physics
Monte Carlo method
Reaction rate
Computer science
Sequence (biology)
Chemistry
Physics
Computational chemistry
Mathematics
Classical mechanics
Biochemistry
Statistics
Catalysis
Publicado: 2023
Citaciones:
8
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Artículo de revista
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