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Design and implementation of multiplexed amplicon sequencing panels to serve genomic epidemiology of infectious disease: A malaria case study
Acceso Abierto
Fuente: Molecular Ecology Resources
Emily LaVerriere
Philipp Schwabl
Manuela Carrasquilla
Aimee R Taylor
Zachary M Johnson
Meg Shieh
Ruchit Panchal
Timothy Straub
Rebecca Kuzma
Sean Watson
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Temas:
Biology
Amplicon
Locus (genetics)
Plasmodium falciparum
Malaria
Infectious disease (medical specialty)
Genetics
Computational biology
Genomics
Disease
Polymerase chain reaction
Immunology
Genome
Gene
Pathology
Medicine
Publicado: 2022
Citaciones:
44
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Artículo de revista
Resolving drug selection and migration in an inbred South American Plasmodium falciparum population with identity-by-descent analysis
Acceso Abierto
Fuente: PLoS Pathogens
Manuela Carrasquilla
Angela Early
Aimee R Taylor
Rubiela Angélica Knudson Ospina
DIEGO FERNANDO ECHEVERRY IBARRA
Timothy J C Anderson
Elvira Mancilla
Samanda L Aponte
Pablo Cárdenas Ramírez
Caroline O Buckee
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Temas:
Biology
Population
Plasmodium falciparum
Malaria
Evolutionary biology
Genetics
Identity by descent
Drug resistance
Balancing selection
Population genetics
Genetic variation
Haplotype
Gene
Demography
Allele
Immunology
Sociology
Publicado: 2022
Citaciones:
19
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Artículo de revista
Impact of piperaquine resistance in Plasmodium falciparum on malaria treatment effectiveness in The Guianas: a descriptive epidemiological study
Acceso Abierto
Fuente: The Lancet Infectious Diseases
Celia Florimond
Franck de Laval
Angela Early
S Sauthier
Yassamine Lazrek
Stephane Pelleau
Wuelton M Monteiro
Maxime Agranier
Nicolas Taudon
François Morin
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Temas:
Piperaquine
Malaria
Plasmodium falciparum
Epidemiology
Virology
Medicine
Immunology
Artemisinin
Internal medicine
Publicado: 2023
Citaciones:
17
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Artículo de revista
Design and implementation of multiplexed amplicon sequencing panels to serve genomic epidemiology of infectious disease: a malaria case study
Acceso Abierto
Fuente: medRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
Emily LaVerriere
Philipp Schwabl
Manuela Carrasquilla
Aimee R Taylor
Zachary M Johnson
Meg Shieh
Ruchit Panchal
Timothy Straub
Rebecca Kuzma
Sean Watson
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Amplicon
Locus (genetics)
Malaria
Biology
Infectious disease (medical specialty)
Plasmodium falciparum
Parasitemia
Genomics
Computational biology
Disease
Genetics
Polymerase chain reaction
Medicine
Immunology
Genome
Gene
Pathology
Publicado: 2021
Citaciones:
4
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Artículo de revista
Resolving drug selection and migration in an inbred South American Plasmodium falciparum population with identity-by-descent analysis
Acceso Abierto
Fuente: bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)
Manuela Carrasquilla
Angela Early
Aimee R Taylor
Rubiela Angélica Knudson Ospina
DIEGO FERNANDO ECHEVERRY IBARRA
Timothy J C Anderson
Elvira Mancilla
Samanda L Aponte
Pablo Cárdenas Ramírez
Caroline O Buckee
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Biology
Population
Plasmodium falciparum
Malaria
Evolutionary biology
Genetics
Identity by descent
Drug resistance
Genetic diversity
Transmission (telecommunications)
Population genetics
Genetic variation
Balancing selection
Plasmodium (life cycle)
Haplotype
Gene
Demography
Allele
Parasite hosting
Immunology
World Wide Web
Computer science
Engineering
Sociology
Electrical engineering
Publicado: 2022
Citaciones:
3
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Artículo de revista
A Short‐Read Amplicon Sequencing Protocol and Bioinformatic Pipeline for Ecological Surveillance of Dipteran Disease Vectors
Acceso Abierto
Fuente: Molecular Ecology Resources
Raquel Lima Cordon
Jason Mohabir
Mohini Sooklall
Aina Martinez Zurita
Meg Shieh
C W Knox
Sabrina Gobran
Zachary Johnson
Margaret Laws
Ruchit Panchal
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DNA barcoding
DNA sequencing
Vector (molecular biology)
Phylogenetic tree
Identification (biology)
Computational biology
Environmental DNA
Genetics
Evolutionary biology
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Ecology
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Biodiversity
Recombinant DNA
Publicado: 2025
Citaciones:
0
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1
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